Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms