Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf4Q60793 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms