Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk2a1Q60737 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms