Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samhd1Q60710 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Samhd1Q60710 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms