Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SkilQ60665 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SkilQ60665 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SkilQ60665 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SkilQ60665 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SkilQ60665 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SkilQ60665 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SkilQ60665 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms