Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CttnQ60598 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms