Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xrcc1Q60596 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms