Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rabl6Q5U3K5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rabl6Q5U3K5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms