Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znrf3Q5SSZ7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms