Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psme4Q5SSW2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms