Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf12Q5SPL2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf12Q5SPL2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms