Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc88aQ5SNZ0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms