Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttf2Q5NC05 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms