Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3558Q5FWC9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms