Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWB5

Gm20909, Predicted gene, 20747, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20909Q5FWB5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20909Q5FWB5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms