Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms