Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrig2Q52KR2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms