Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2cd3Q52KB6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2cd3Q52KB6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms