Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdv3Q4VAA2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdv3Q4VAA2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdv3Q4VAA2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdv3Q4VAA2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdv3Q4VAA2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdv3Q4VAA2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdv3Q4VAA2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdv3Q4VAA2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdv3Q4VAA2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdv3Q4VAA2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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