Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc84Q4VA36 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms