Protein–RNA interactions for Protein: Q499M4

Tigd5, Tigger transposable element derived 5, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd5Q499M4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tigd5Q499M4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tigd5Q499M4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms