Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap2Q3V1H1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2Q3V1H1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms