Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ulk4Q3V129 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms