Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rimbp3Q3V0F0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rimbp3Q3V0F0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms