Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnpc3Q3UZ01 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms