Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28047Q3US59 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms