Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TceancQ3US16 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TceancQ3US16 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms