Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3UPC7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q3UPC7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q3UPC7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UPC7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UPC7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms