Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms