Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms