Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CrxosQ3UL53 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CrxosQ3UL53 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms