Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam83fQ3UKU4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms