Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms