Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dtx3lQ3UIR3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dtx3lQ3UIR3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms