Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc34Q3UI66 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms