Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx6-3Q3UHX8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx6-3Q3UHX8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms