Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms