Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE70

Gm21748, Predicted gene, 21748, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21748Q3UE70 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21748Q3UE70 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms