Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cops9Q3U898 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cops9Q3U898 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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