Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf180Q3U827 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Rnf180Q3U827 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Rnf180Q3U827 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Rnf180Q3U827 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf180Q3U827 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Rnf180Q3U827 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf180Q3U827 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf180Q3U827 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf180Q3U827 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf180Q3U827 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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