Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms