Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U595 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U595 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U595 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U595 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U595 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U595 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U595 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q3U595 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q3U595 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q3U595 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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