Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VwceQ3U515 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VwceQ3U515 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms