Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf149Q3U2C5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf149Q3U2C5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf149Q3U2C5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf149Q3U2C5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf149Q3U2C5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf149Q3U2C5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf149Q3U2C5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rnf149Q3U2C5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnf149Q3U2C5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf149Q3U2C5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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