Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms