Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms