Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc174Q3U155 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms