Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rufy4Q3TYX8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms