Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf6Q3TWW8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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