Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Ccndbp1Q3TVC7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccndbp1Q3TVC7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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